Выделение область на CFA 15 связанную с интенсивностью феомеланина у Толлеров позволило, связать её с интенсивностью пигмента шерсти у собак. Анализ вариантов выявил CNV в 6 т.п.н. выше KITLG, что было тесно связано с интенсивностью феомеланина у собак породы Толлер (p <0,0001) и у других пород. Число копий CNV в значительной степени связано с интенсивностью эумеланина у пуделей и разных пород и, в меньшей степени, с феомеланином. У всех протестированных волков было две копии этого элемента, что указывает на то, что хромосомы с более высоким числом копий и высокой интенсивностью пигмента представляют собой производное состояние. Интенсивность пигмента обусловлена ​​различным распределением пигмента вдоль стержня волоса: особи с низким числом копий имеют более светлые волосы у корня, в то время как более интенсивно пигментированные особи не имеют разницы в интенсивности пигмента от корня до кончика волоса. У породы пудель шерсть постоянно растёт, по этой причине разница в цвете, связанная с разными аллелями CNV, особенно заметна.

​

Ранее было показано, что KITLG и его рецептор, KIT, участвуют в гемопоэзе (прим. пер: Гемопоэз – это процесс образования форменных элементов крови), меланогенезе (прим. пер: Меланогенез – это процесс образования меланина) и гаметогенезе (прим. пер: Гаметогенез или предзародышевое развитие — процесс образования половых клеток, или гамет). Плейотропные эффекты генов (прим. пер: Плейотропи́я — явление множественного действия гена. Выражается в способности одного гена влиять на несколько фенотипических признаков.), ответственных за изменение окрасов шерсти, обычны у млекопитающих. В этом случае эта пара рецепторов лиганда необходима для миграции и пролиферации популяций стволовых клеток во время развития. Эти популяции стволовых клеток включают первичные половые клетки, гематопоэтические клетки-предшественники и меланобласты. Помимо этой функции раннего развития при миграции меланобластов, KITLG важен для постнатального кожного меланогенеза. В частности, экспрессия KITLG важна в эпителиальных клетках волосяных фолликулов для терминальной дифференцировки меланоцитов. Существенная роль, которую KITLG играет в меланогенезе, как в процессе развития, так и в стержне волоса, согласуется с его идентификацией в качестве локуса интенсивности пигментации у собак.

​

Варианты KITLG и его рецептора KIT вызывают изменения пигментации у человека. Было показано, варианты кодирующей последовательности в KITLG вызывают семейную прогрессирующую гиперпигментацию с гипопигментацией или без неё, а также синдром Ваарденбурга типа 2 (с пигментными аномалиями). Кроме того, варианты кодирования рецептора KIT были связаны с классическим аутосомно-доминантным заболеванием пьебалдизм, характеризующимся врождёнными участками кожи без присутствия меланоцитов. Однако было показано, что регуляторные варианты влияют на интенсивность пигментации. Sulem et al в 2007 обнаружили, что гены выше KITLG были связан с цветом волос при сканировании ассоциации по всему геному у исландцев и голландцев. Этот вариант, вероятно, лежит в неравновесном сцеплении, с расширенным гаплотипом выше KITLG, демонстрирующим сильную сигнатуру отбора у людей. Guenther et al в 2014 обнаружили, что эта область управляет экспрессией исключительно в волосяных фолликулах, используя репортерные конструкции у мышей. KITLG выполняет различные важные функции развития; однако изменение экспрессии влияет только на волосяные фолликулы и может быть средством ограничения эффектов фенотипами пигментации.

​

Было установлено, что регуляторные варианты KITLG (или Kitl у мышей) вызывают различия в пигментах у других видов животных. Первоначальные мутации у мышей, связанные с Kitl, были названы стальными из-за их равномерно разбавленной окраски шерсти. Аллель у серой панды вызван инверсией, которая нарушает вышестоящую регуляторную область Kitl, что также приводит к ослаблению пигментации. И у коз, и у норок экспрессия KITLG ниже у светлых животных по сравнению с более тёмно пигментированными животными. В этой работе уровни экспрессии KITLG не оценивались из-за проблем с получением образцов кожи от здоровых домашних собак; однако, основываясь на работе, проделанной на других видах, CNV, вероятно, изменяет уровни экспрессии KITLG в волосяном фолликуле.

​

В то время как у многих протестированных пород собак интенсивность пигментации зависела от CNV KITLG, некоторые породы с вариацией феомеланина не зависела от CNV KITLG. Примечательно, что у Золотистых ретриверов и Лабрадоров была изменчивость по CNV, но она не коррелировала с окрасом их шерсти, что указывает на то, что у собак все ещё существуют дополнительные неисследованные локусы или варианты, которые влияют на интенсивность пигментации. Кроме того, у белых пуделей, вероятно, есть несколько генов, включая CNV KITLG и MFSD12, участвующих в формировании их фенотипа. Неудивительно, что многие локусы влияют на пигментацию, поскольку собаки подвергаются столь сильному искусственному отбору и имеют такое разнообразие окрасов шерсти.

​

CNV KITLG ранее связывали с предрасположенную к плоскоклеточной карциноме пальцев (DSCC) у собак c интенсивным окрасом. Анализ был проведён на случаях DSCC с интенсивным пигментом и контрольной группы собак, и большое количество копий CNV было идентифицировано как локус предрасположенности; однако этот эффект был обнаружен только в случаях эумеланизма с функциональным MC1R (прим.пер.: Е-). С вариациями локуса  KITLG связывают в развитие меланомы, рака яичек, колоректального рака и общего риска рака у людей. В случае риска развития DSCC у собак в аллели  имелось больше  четырёх копий CNV, и у гомозиготных животных вероятность наличия DSCC была выше. У собак с черным окрасом чаще были случаи DSCC, так как 92% образцов были взяты именно от собак с черной пигментацией. Однако есть породы, такие как гладкошёрстный Ретриверы с высоким числом копий, черной шерстью и собаки этой породы не предрасположены к этому типу опухолей. Возможно, что высокое количество копий CNV в KITLG является ещё одним дополнительным фактором риска для пород, которые более восприимчивы к этому типу опухолей. Так же можно предположить, что некоторые черные собаки с высоким числом копий CNV в KITLG также могут иметь защитные аллели.

​

Варианты человеческого KITLG, влияющие на цвет волос, расположены в области, аналогичной CNV, идентифицированной у собак. Копии CNV на 86,1% идентичны человеческой последовательности. Человеческая гомологичная область CNV как и у собак расположена на 200 т.п.н. выше человеческого KITLG. Самая сильная селективная сигнатура для KITLG у человека расположена на 218 т.п.н. выше кодирующей последовательности, в то время как SNV, связанные со светлой пигментацией, расположены на 355 т.п.н. выше KITLG. Изменения KITLG у собак произошли под давлением искусственного отбора, это одна из 20 областей генома, в которых наблюдаются изменения, связанные с селекция у домашних собак. Интересно, что люди у собак выбирают более интенсивную пигментацию по сравнению с волками с окрасом дикого типа. Яркая и насыщенная пигментация домашних собак - это один из способов отличить их от волков. У волков есть только одна копия этой области размером 6 т.п.н., что указывает на то, что амплификация  области произошла у домашних собак. (прим.пер.: Амплификация в молекулярной биологии — процесс образования дополнительных копий участков хромосомной ДНК.) Можно предположить, что это могло быть одним из полезных способов отличить прото-собак партнёров человека от их диких предков.